Shinichi Kudo/Història
Com que durant la majoria de la història té lloc com a Conan, en Shinichi poques vegades apareix a la sèrie. Les aparicions de sota, són aparicions reals d'en Shinichi, així com flashbacks d'abans de començar la sèrie.
Història Canon
Transformació a Conan
El detectiu més famós d'aquest segle (Manga: 001-002, Anime: 001)
En Shinichi es presenta al cas d'assassinat de la muntanya russa, però al final de l'episodi es transforma en Conan, i així comença l'argument de la sèrie. Des de llavors, en Conan ha tornat a ser en Shinichi temporalment en alguns casos.
Transformació altre cop a Shinichi
El gran detectiu de l'oest (Manga: 092-095, Anime: 048-049)
La següent aparició real d'en Shinichi després d'encongir-se té lloc quan apareix un estrany detectiu d'Osaka anomenat Heiji Hattori a l'Agència de Detectius Mouri buscant en Shinichi. En Conan està refredat, i per curar-lo, en Heiji li dona un licor anomenat Baikal. Aquest licor, misteriosament, fa que en Conan torni a créixer a la forma de Shinichi temporalment. Aquesta transformació dura poc, i fa que en Conan desenvolupi una resposta immunitària al licor, per la qual cosa ja no li serveix per transformar-se un altre cop.
Un retorn perillós (Manga: 254-260, Anime: 188-193)
En Conan pot tornar a esdevenir Shinichi fent servir un antídot que la Haibara ha sintetitzat. Com a ell mateix, prova de sorprendre la Ran apareixent com a actor en una obra de teatre, però és interromput per un assassinat que fa que s'acabi revelant a l'institut sencer. En Heiji Hattori l'encobreix, i es pot passar 48h com a ell mateix. Torna a encongir-se en Conan quan sembla que s'està a punt de declarar a la Ran.
Shinichi Kudo, l'assassí (Manga: 646-651, Anime: 521-523)
La pròxima aparició d'en Shinichi Kudo és, mentre resolen un cas amb en Heiji, en Conan desapareix i al seu lloc apareix en Shinichi. Aquest "Shinichi" realment és una persona que s'ha fet cirurgia plàstica per assemblar-se a en Shinichi i està intentant de culpar en Shinichi per assassinat. El Shinichi real s'amaga al bosc fins que pugui netejar el seu nom. Ha tornat a ser ell temporalment gràcies a un dels antídots de la Haibara. Quan el cas es resol, en Shinichi torna a transformar-se en Conan, però la Haibara el salva donant-li un altre antídot, evitant així que la seva identitat sigui revelada a en Kogoro, la Ran i la Kazuha. Mentre tornen a casa, el grup és interromput per un altre assassinat, que en Heiji i en Shinichi, junts, resolen, tot i que la transformació en Conan és imminent. Un cop resolt el cas, la Ran intenta evitar que en Shinichi se'n vagi, dient que té alguna cosa a dir-li. Shinichi l'atura, dient "Segons les meves deduccions, el que has de dir i el que he de dir és el mateix". La Ran agafa la seva mà mentre es transforma de nou en Conan, i encara que Haibara l'adorm amb el rellotge de polsera d'en Conan, ell es nega a deixar anar la seva mà. La Haibara i el doctor Agasa han de tallar i tornar a enganxar-li la camisa d'en Conan perquè la Ran encara li agafa la mà i es nega a deixar-li anar.
El llibre de l'Apocalipsi de Holmes (Manga: 743-751, Anime: 616-621)
En Conan, la Ran i en Kogoro són convidats a Anglaterra per una dona rica, Diana Kingstone, després que en Kogoro trobés el seu gat sota una taula al Cafè Poirot. Tot i això, com que en Conan no té passaport per volar internacionalment, l'Ai li dona el prototip d'antídot perquè en Shinichi i l'Agasa puguin volar fins a Anglaterra amb el mateix vol que la Ran i en Kogoro. La Haibara li dona una segona pastilla, per la tornada, però en Conan es veu obligat a utilitzar-la mentre la Ran el persegueix, a Londres. Durant el viatge, en Shinichi respon els sentiments dolguts de la Ran, dient-li que es preocupa per ella, però abans que li pugui confessar els seus sentiments, s'esvaeix i torna a aparèixer en Conan. Per sort, però, els pares d'en Shinichi apareixen i li donen una píndola extra per tornar al Japó.
L'excursió escarlata (Manga: 1000-1005, Anime: 927-928)
En Shinichi retorna al seu cos real per anar a una excursió el seu institut a Kyoto. En Shinichi es veu involucrat en un misteri d'assassinats en sèrie. Després de resoldre el cas, en Shinichi li pregunta a la Ran què sell per ell, ja que ella mai ha respost la seva confessió de Londres. La Ran respon fent-li un petó a la galta. Abans que en Shinichi li pugui respondre amb un petó, l'efecte de l'antídot passa, i en Shinichi ha de córrer perquè ningú descobreixi la seva identitat.
Tot i que en Shinichi demana a la policia que mantingui el seu involucrament en el cas en secret, apareixen rumors d'un detectiu juvenil ajudant al cas per internet. Un d'ells diu haver vist en Shinichi a Kyoto. Aquests rumors no passen desapercebuts per en Hyoue Kuroda i en Kanenori Wakita.
Aparicions flashback
El primer cas d'en Shiníchi Kudo (Manga: 204-207, Anime: 162)
Un any abans del començament de la sèrie, en Shinichi va resoldre el seu primer cas en un avió volant a Los Angeles.
La poma daurada (Manga: 350-354, Anime: 286-288)
Un any abans del començament de la sèrie, En Shinichi, la Ran i la seva mare van anar a Nova York per veure l'obra de teatre "La poma daurada". Allà, es troben la Sharon Vineyard i en Shuichi Akai.
Els records d'en Heiji (Manga: 518-521, Anime: 490)
Durant una trucada a en Conan, en Heiji parla d'un detectiu brillant que va conèixer durant un viatge d'esquí tres anys abans. Aquest detectiu era en Shinichi, amb qui va competir per resoldre un misteri.
Repte del Kaito Kid original (Manga: 570-573, Anime: 472-473)
Un flashback revela que, 10 anys abans, com a estudiants de primer curs, en Shinichi i la Ran van rebre una endevinalla del Kaito Kid original, en Toichi Kuroba.
Records de l'aquari (Manga: 882-884, Anime: 772-773)
Durant una visita a l'aquari amb en Conan i la Lliga de detectius júnior, la Ran recorda haver anat a l'aquari amb en Shinichi un any abans. Després de resoldre un cas allà, es revela com en Shinichi li promet la visita a Tropical Land.
Records de la classe dels cirerers (Manga: 921-924, Anime: 853-854)
13 anys abans, la Ran i en Shinichi es coneixen per primer cop a la guarderia.
La trobada a la platja (Manga: 972-974, Anime: 881-882)
10 anys abans, en Shinichi i la Ran es troben la Família Akai a la platja.